Under en gastroskopi undersöker endoskopisten magens inre med ett gastroskop. Det är mjuk slang som leds ner till magsäcken genom munnen.

Under en koloskopi undersöker endoskopisten tjocktarmen med ett koloskop. Det är en mjuk slang som förs in genom ändtarmsöppningen.

I en sigmoideoskopisk undersökning är det enbart ändtarmen och den nedre delen av tjocktarmen som undersöks med ett koloskop.